Jonkersvaart (Gronings: Jonkersvoart) is een streekdorp gelegen langs het gelijknamige kanaal in de gemeente Marum in Groningen (Nederland) en heeft ongeveer 260 inwoners.

De jonker waaraan het kanaal zijn naam te danken heeft is F.F. van In- en Kniphuizen, de jonker van Nienoord, die dit kanaal eind 18e, begin 19e eeuw heeft laten aanlegen ter ontginning van het veen.
Naar zijn vrouw A.M. Graafland is een zijtak van de Jonkersvaart het Graaflandsdiep genoemd. De naam wordt echter tegenwoordig als Gravelandsewijk gespeld (een wijk is een watergang die dwars op een kanaal staat).
In 1871 werd een verbinding met Friesland via de Wilpstervaart gemaakt. Daarvoor werd het Jonkersverlaat aangelegd.