Waterhuizen is een dorp in de gemeente Hoogezand-Sappemeer in de provincie Groningen in Nederland. Het is gelegen aan het Winschoterdiep, op de plek waar de Hunze tegenwoordig uitmondt in het diep.

Het is vooral bekend vanwege de eerste dwarshelling die men tegenkomt als men vanaf Groningen langs het kanaal richting Hoogezand gaat.